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圣路易斯一带的地域在建城前大多为草原和稀树森林为主。主要树种包括橡树，枫树，山核桃木等，具有典型的奥索卡山脉的特征，而河滨地区则以美国梧桐为主。现今圣路易斯城大部分的居民区种植的也是本地的各种行道树。同时日本忍冬等入侵物种对本地树木造成了一些负面影响。城市附近的大型哺乳动物包括野狼和白尾鹿，而北美灰松鼠，野兔和负鼠等也很常见。大型鸟类包括加拿大黑雁，野鸭，以及在密西西比河沿岸栖息的白鹭，苍鹭和鸥等。圣路易斯城也位于许多北美候鸟的迁徙路线上，冬天在岩石链桥（Chain of Rocks Bridge）周围可以看到很多的白头鹫。春季尤其是在雨季候青蛙也相当常见。由于七八两月蚊蝇偏多，城内的房屋一般都配有纱窗。